Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SOBPA7XYQ1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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