Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USP18Q9UMW8 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP18Q9UMW8 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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