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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6
OPN4, Melanopsin, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
OPN4
Q9UHM6
RNU4-45P-201
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141 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1336P-201
ENST00000383886
109 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
SNORA50A-201
ENST00000384225
134 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-447P-201
ENST00000410293
104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1118P-201
ENST00000410382
104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1076P-201
ENST00000410397
104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-355P-201
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BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-791P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-705P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1100P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-860P-201
ENST00000410860
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1217P-201
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104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-785P-201
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104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU7-102P-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
AC130289.1-201
ENST00000577321
73 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
MIR3612-201
ENST00000579753
87 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
AC008608.1-201
ENST00000603910
127 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
U6.90-201
ENST00000614007
104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
U6.70-201
ENST00000620287
104 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
CALCRL-202
ENST00000409998
5223 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
MIR18A-201
ENST00000362310
71 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-945P-201
ENST00000383947
107 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.515-201
ENST00000384535
112 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-768P-201
ENST00000384683
107 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
MIR140-201
ENST00000385282
100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6ATAC42P-201
ENST00000408637
95 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
SNORD93-201
ENST00000408813
74 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
AC107027.2-201
ENST00000512197
115 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1219P-201
ENST00000516143
112 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
AC090897.1-201
ENST00000580909
226 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
SNORD92-201
ENST00000585078
85 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.52-201
ENST00000362760
96 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.233-201
ENST00000364407
101 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.258-201
ENST00000364613
105 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-312P-201
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107 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.274-201
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101 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
VTRNA1-3-201
ENST00000365645
89 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNY1P6-201
ENST00000384193
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-893P-201
ENST00000458841
100 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC079466.2-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.188-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1082P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.297-201
ENST00000364950
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.337-201
ENST00000365312
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.401-201
ENST00000383965
117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
SNORA18-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORD100-201
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76 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU4-83P-201
ENST00000410863
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1271P-201
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP330-201
ENST00000517096
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC022559.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC141846.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
CLRN1-AS1.1-201
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79 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR924-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-818P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
SNORA75.5-201
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81 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
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Y_RNA.674-201
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BASIC
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OPN4
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RNU6-448P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.757-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
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AC141273.2-201
ENST00000618989
130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
CEP290-203
ENST00000547691
5968 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR330-201
ENST00000362196
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.42-201
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108 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.357-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
U8.15-201
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134 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP144-201
ENST00000410846
116 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU5E-9P-201
ENST00000411164
104 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.793-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
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130 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP236-201
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116 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR8066-201
ENST00000617280
78 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AC078938.1-201
ENST00000620993
318 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR6844-201
ENST00000637122
62 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-349P-201
ENST00000362402
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-379P-201
ENST00000363813
104 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP117-201
ENST00000365294
118 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-949P-201
ENST00000384040
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.552-201
ENST00000384665
112 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-239P-201
ENST00000390990
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
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84 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU7-113P-201
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62 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1258P-201
ENST00000516911
111 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
AP002392.1-201
ENST00000537692
208 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MIR8087-201
ENST00000612745
78 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.13-201
ENST00000362403
112 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.115-201
ENST00000363272
98 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP457-201
ENST00000363657
124 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNY1P13-201
ENST00000365030
105 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-690P-201
ENST00000365242
106 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
SNORA72.6-201
ENST00000384520
129 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
MT-TG-201
ENST00000387429
68 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-679P-201
ENST00000391003
106 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.588-201
ENST00000391254
102 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1086P-201
ENST00000410930
100 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
OPN4
Q9UHM6
ATP6V0E1P1-201
ENST00000412537
226 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
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