Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBM28Q9NW13 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RBM28Q9NW13 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RBM28Q9NW13 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms