Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SEMA4CQ9C0C4 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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