Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VGLL1Q99990 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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VGLL1Q99990 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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VGLL1Q99990 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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VGLL1Q99990 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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VGLL1Q99990 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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VGLL1Q99990 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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VGLL1Q99990 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VGLL1Q99990 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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