Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CDO1Q16878 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CDO1Q16878 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CDO1Q16878 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms