Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNRNP35Q16560 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNRNP35Q16560 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNRNP35Q16560 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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