Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGA3Q16281 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
CNGA3Q16281 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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