Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USF2Q15853 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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