Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
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