Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1CQ15572 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1CQ15572 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TAF1CQ15572 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms