Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SIX1Q15475 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SIX1Q15475 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SIX1Q15475 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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