Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNX17Q15036 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNX17Q15036 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.1 ms