Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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