Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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COL19A1Q14993 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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COL19A1Q14993 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL19A1Q14993 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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COL19A1Q14993 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
COL19A1Q14993 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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