Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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GPNMBQ14956 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GPNMBQ14956 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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GPNMBQ14956 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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GPNMBQ14956 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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GPNMBQ14956 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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GPNMBQ14956 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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GPNMBQ14956 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GPNMBQ14956 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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