Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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CHD4Q14839 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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CHD4Q14839 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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CHD4Q14839 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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CHD4Q14839 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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