Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RFTN1Q14699 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms