Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IRF3Q14653 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IRF3Q14653 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IRF3Q14653 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.2 ms