Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RBM39Q14498 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RBM39Q14498 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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