Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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