Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCIRG1Q13488 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCIRG1Q13488 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCIRG1Q13488 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.9 ms