Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SMAD4Q13485 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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