Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LSAMPQ13449 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LSAMPQ13449 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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