Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
AP3B2Q13367 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP3B2Q13367 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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