Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3BQ13214 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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SEMA3BQ13214 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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SEMA3BQ13214 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3BQ13214 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3BQ13214 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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