Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP4Q13107 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP4Q13107 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP4Q13107 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
USP4Q13107 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP4Q13107 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP4Q13107 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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USP4Q13107 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP4Q13107 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP4Q13107 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP4Q13107 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP4Q13107 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP4Q13107 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP4Q13107 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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USP4Q13107 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP4Q13107 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP4Q13107 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP4Q13107 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP4Q13107 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP4Q13107 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USP4Q13107 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP4Q13107 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
USP4Q13107 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP4Q13107 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP4Q13107 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP4Q13107 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP4Q13107 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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