Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHD3Q12873 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
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