Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNTN1Q12860 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNTN1Q12860 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNTN1Q12860 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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