Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
CPSF1Q10570 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CPSF1Q10570 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CPSF1Q10570 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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