Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RBBP4Q09028 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RBBP4Q09028 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RBBP4Q09028 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RBBP4Q09028 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RBBP4Q09028 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RBBP4Q09028 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms