Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGGTBP53611 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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RABGGTBP53611 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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RABGGTBP53611 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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RABGGTBP53611 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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RABGGTBP53611 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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RABGGTBP53611 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
RABGGTBP53611 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGGTBP53611 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGGTBP53611 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGGTBP53611 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGGTBP53611 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGGTBP53611 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGGTBP53611 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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