Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATRXP46100 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATRXP46100 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms