Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXD10P28358 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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HOXD10P28358 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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HOXD10P28358 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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HOXD10P28358 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXD10P28358 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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