Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TSPAN9O75954 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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TSPAN9O75954 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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TSPAN9O75954 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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TSPAN9O75954 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TSPAN9O75954 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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TSPAN9O75954 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TSPAN9O75954 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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TSPAN9O75954 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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TSPAN9O75954 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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