Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LRRTM2O43300 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LRRTM2O43300 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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