Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
TSPAN4O14817 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPAN4O14817 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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