Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN4O14493 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
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CLDN4O14493 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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CLDN4O14493 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN4O14493 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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