Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm4T1NXB5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms