Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac5Q9Z2V6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms