Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms