Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4b1Q9WV76 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms