Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms