Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps29Q9QZ88 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms