Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dkk3Q9QUN9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms