Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1aQ9JLR9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms