Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms