Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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