Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms